Bloom, une jeune fille sans histoire, habite à Gardenia . Lors d'une promenade à vélo dans le parc, Kiko, aperçoit qu'une fée est en danger. Elle se bat contre un ogre terrifiant. Alors, Bloom décide de passer à l'action. C'est à ce moment-là que Bloom découvre qu'elle a des pouvoirs magiques. Après avoir sauvé la jeune fille, Bloom rentre chez elle et en parle à ses parents. La jeune fille, rudement blessée, se réveille et se présente, elle se nomme Stella. Mais le problème, c'est que Stella, est une fée, et elle doit rentrer à Alféa, une école de magie. Bloom hésite à y aller. Le soir même, le térrifiant ogre ataque à nouveau Stella chez Bloom, après un dur combat, Stella et Bloom gagnent et décident de s'en aller pour Alféa .

Bloom part de la Terre pour aller à Alféa avec Stella, la grande école des fées dans la dimension magique (Magix). Elle y rencontre Flora, Musa et Tecna. Il y a aussi dans Magix une autre école : Tour Nuage, une école pour sorcières où les Trix (Icy, Darcy et Stormy) étudient la magie noire.

Alfea et l'école des chevaliers spécialistes voisine, Fontaine Rouge, organisent un grand bal en l'honneur des nouveaux étudiants. Toutes les fées sont très excitées, mais les Trix font irruption et comptent bien gacher la fête. Mais Bloom et les Winx déjouent leur piège et leur retournent la pareille.

Les Winx participent à un voyage scolaire pour tester leur capacité à travailler dans la nature sans magie, mais les Trix font irruption.

Stella est invitée à aller à un rendez-vous avec le prince Sky. Après ce rendez-vous, Stella commence à agir étrangement. Il s'avère que le rendez-vous était un piège.

Les Winx vont à la Tour Nuage pour récupérer la bague de Stella de Solaria. Mais Mme Griffin, la directrice de la Tour Nuage, leur tend un piège . Cependant Bloom sauvera ses amies grâce à une mystérieuse voix ..

Après les événements de la Tour Nuage, les Winx sont punies d'une perte temporaire de leurs pouvoirs. Les Trix profitent de l'occasion pour attaquer. Mais elles seront interrompues par Faragonda, de retour de la soirée de Magix .

Au cours de la Fête des Roses, Bloom et Riven tombent dans un piège tendu par Trix qui cherche à diviser la relation étroite entre les Spécialistes et les Winx.

Les hostilités entre les Winx et Riven sont tendues, surtout que Musa a quelques sentiments pour lui. Bloom montre d'étranges pouvoirs qui intéresseront les Trix . 

Les Trix infiltrent un test de réalité virtuelle pour découvrir et s'emparer du Pouvoir de la Flamme du Dragon détenu par Bloom.